Gastrik bypass ile hem gıda alımını hem de gıda emilimini kısıtlar. Midenin neredeyse %95’lik bölümü, on iki parmak bağırsağı ve ince bağırsağın ilk 1 metrelik üst kısmı devre dışı bırakılmış yani tıbbi anlamda bypass edilmiş olur. Gastrik bypass, mide boyutunu %90’ın üzerinde azaltır. Normal mide, bazen 1000 ml’ye kadar genişleyebilir. Gastrik bypass poşu ise 15-30 ml boyutundadır. Gastrik bypass poşu midenin en az esneyebilen üst kısmında oluşturulmaktadır ve bu sayede uzun dönemde poşun hacminde anlamlı bir artış olmaz.

​

Hasta küçük miktarda gıda aldığında oluşan ilk yanıt, mide poşunun duvarının gerilmesi ve beyne midenin dolu olduğunu bildiren sinirleri uyarmasıdır. Hasta adeta büyük bir öğün yemiş gibi doygunluk hisseder, fakat aslında birkaç kaşık yemiştir. Pek çok kişi doygunluk hissettiğinde yemeyi kesmez. Fakat hastalar, artan rahatsızlık veya kusmadan korunmak için, daha sonraki lokmalarını çok yavaş ve dikkatlice yemeleri gerektiğini çok hızlı şekilde öğrenirler. Bu sayede hasta hem az yediği için hem de yedikleri mideden sonra bağırsağın başına değil, doğrudan sonuna gittiği için çabuk kilo kaybeder.

​

Bu operasyonun en büyük avantajlarından biri ise alınan gıda ve geriye kalan (gıda girmeyen) midenin ürettiği sıvıların (enzimler, safra ve pankreas sıvıları) hemen değil, ileri bir noktada birleşiyor olmasıdır. Böylelikle yağ ve şeker emilimi, yani kalori emilimi azalmış olmaktadır (emilim azaltıcı etki).

​

Ayrıca, küçültülmüş midenin bağırsağa geçiş noktasının normale göre daha küçük olması ile midenin yavaş boşalmasını sağlanmakta ve hastalarda daha uzun bir tokluk hissi yaratılmış olmaktadır.